Коренной саратовец. 35 лет прожил в Агафоновке, где учился в 82-й и 97-й средних школах Октябрьского района.
Трудовую деятельность начал в возрасте 16 лет рабочим. С 1972-го по 1975 год проходил службу в г. Севастополе на крейсере «Жданов» командиром отделения, старшиной команды, где стал коммунистом, и с той поры убеждений не менял.
После окончания в 1980 году Саратовского юридического института был избран секретарем комитета комсомола Саратовской школы милиции, а затем секретарем Кировского райкома комсомола.
С сентября 1981- го по сентябрь 1991 года – на партийной работе. Работал в Кировском райкоме, Саратовском горкоме КПСС.
После августовского переворота 1991 года и запрета КПСС занимался предпринимательской деятельностью, создал и возглавил юридическую фирму, работал заместителем генерального директора по правовым вопросам в производственно-научной ассоциации «Росс», объединяющей более 100 крупнейших предприятий и организаций Саратова.
В 1993 году Сергей Афанасьев стал одним из инициаторов восстановления Компартии на территории Саратовской области. В настоящее время – заместитель Председателя ЦКРК КПРФ, секретарь Саратовского обкома КПРФ. После выборов в Саратовскую областную думу первого созыва был приглашен на работу в качестве консультанта председателя, а с сентября 1994 года – заведующего секретариатом заместителя председателя областной думы. С 1998-го по 1999 год – помощник депутата Государственной Думы РФ.
В декабре 1999 года С. Н. Афанасьев был избран депутатом Государственной Думы по 159-му Энгельсскому избирательному округу. Член Комитета по государственному строительству. Является автором и соавтором более 30 законов Российской Федерации. Специалист в области избирательного права. Член Координационного Совета Российского Союза Юристов.
Сергей Николаевич Афанасьев – помощник депутата Государственной Думы ФС РФ Рашкина В. Ф.
С 2004-го по 2006 год был членом избирательной комиссии Саратовской области. В состав комиссии выдвинут Саратовским областным отделением КПРФ.
В марте 2006 года С. Н. Афанасьев избран депутатом Саратовской городской думы. Заместитель председателя постоянной комиссии по бюджетно-финансовым вопросам, экономике, использованию муниципальной собственности, местным налогам и сборам.
Женат. Двое детей: дочь 29-ти лет и сын 21-го года.
Проживает в Волжском районе г. Саратова.